大天后宫原为「明宁靖王府邸」,施琅攻台后即进驻宁靖王府,后来因得知康熙帝对其有「恃功骄纵」之评语,恐惹来杀身之祸,便撤出王府,并托言攻台时得到妈祖庇护,奏请康熙帝将王府改建为「大天妃宫」,以示不居功之意。康熙廿三年,妈祖晋升为「天后」,大天妃宫随即易名为大天后宫,是台湾妈祖庙中最早称「天后」者。
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