医疗学即本教恰辛派“养生医方”之说。《善缘项饰》说：“杰普赤席王子即辛饶由身化现之第二子，系挥萨杰美夫人于赤门杰席所生，受教于其父并发大心，掌握医疗术等苯教诸法，贯通二万一千《疗续》大典，成就医药本师不二者，审编《疗方三十万》等。”由此可知杰普赤席著述医典宏扬医方明之大概。其中贯通二万一千《疗续》之意在《无垢光辉经》中说：“审定《疗方五部大续》，《九部大经》，《八支秘诀》，《小支二万一千》等，传交杰普赤席王子及八大仙人掌管”。虽曾产生过如此众多而深广的医典，但实际保存至今的只有《苯教甘珠尔》中的《甘露宝藏四本目》，即普措赛白杰波的伏藏《根本医典蓝本目》、《养生药典白本目》、《疗方花本目》、《治病黑本目》。此四本目乃《九部大经》中的《四个本目》。著名的藏医《四部医典》（或《四续》亦根源于《疗方五部大续》。由大译师毗卢遮那译自苯教之医典。据尼玛丹增所撰《甘珠尔编目序言》，《四部医典》中祈请仙人之名及医疗咒语均原封不动地保持了象雄语，充分说明了其源自苯教医典。此外，由三个印度瑜伽咒士从桑耶寺找到的伏藏本，亦应是杰普赤席所说之《医药经》及《七章本疏》等无疑。后期在藏流传的医疗学源自古象雄文化之一明证是：敦煌古藏文文献中，关于药方有两卷，火灸方两卷，共四卷，其中一火灸方卷后记中说：“此卷在库中亦无，乃从所有疗方中搜集，并与象雄之根本疗方相配而成。”

　　医学在分析判断某一病症在病理上的远近诸种病因时，离不开卜算占卦，因此，在以五明之学分类时，这种卜算占卦之术便收类于医方明之中。辛饶弥沃奇在为恰辛祖飞列加等人开示恰辛苯教之法时，亦将“度”（禳解）、疗方、“求提”、占卜、圆光、占音、算学、医药学合融在一起，也鉴于此理。

　　藏医最基本的典籍是《医学四续》，即《本续》，《释续》，《诀窍续》和《后续》。《贤者喜宴》载：“集一切秘诀之精华的《医学四续》系由玉妥贡布所著，玉妥贡布乃真正的应化身，汇集了藏地所有医典诀窍之传承，六度赴印”，又载“赤列法王云：（玉妥贡布）乃真正之殊胜化身。他住地之东面山上长满各类药草如香山，南面山上长满热性药草，北面雪山上生长凉性药草，西面有森林，尤如奇妙医药城（药师佛净土），他的心性法界为药师佛，以各种思维为四部眷属，著念为益列吉仙，本明之性为本明智慧仙而开示四续”。又载“有的认为是药师佛所说，有的认为如同化身毗卢遮那开示瑜伽密续，于须弥山之颠一样，乃为释迦佛祖之化身示教，也有认为是伏藏，有的认为原有一小《本续》而由玉妥贡布作广本，如此等等，不一而足。但以果证而论，此著者应为化身佛，而以切脉、视尿诊断者，未见于其它医方，乃世界医学之殊胜者，尤其切合藏地之地理气候，惠泽无量，是故顶礼如佛。”《知识总汇》载：“关于《四续》，有认为是佛说与论典之任一者，有认为佛说与论典兼而有之者，即使认为是论典者，亦有众多不同说法，但旦白宁奇法王师徒等认为：外为佛说，内为伏藏，秘为玉妥巴之作为佳。”《善说宝串》中说：适宜藏地地理气候之《四续》，即由此化身佛所撰，如同玉妥巴在其《宁提》中所说，然而大多认为是佛说，由扎巴恩息坚掘藏而得。宁玛巴之《十万密续》中亦持此论。